中國水產(chǎn)科學(xué)研究院珠江所破解羅氏沼蝦基因組密碼為產(chǎn)業(yè)升級注入新動能
時間:2025-07-25 10:27 來源:中國水產(chǎn)科學(xué)研究院 原文:
近日,中國水產(chǎn)科學(xué)研究院珠江水產(chǎn)研究所淡水蝦遺傳育種于凌云研究團隊在羅氏沼蝦基因組解析領(lǐng)域取得重要進展。其研究成果以 “A high-quality chromosome-level genome assembly and annotation of the giant freshwater prawn (Macrobrachium rosenbergii)” 為題,正式在線發(fā)表于國際知名專業(yè)期刊《Scientific Data》(JCR 1區(qū))。該研究由于凌云副研究員和劉海洋博士共同擔(dān)任第一作者,王亞坤博士和朱新平研究員為共同通訊作者。


羅氏沼蝦作為全球重要的商業(yè)淡水蝦品種,憑借肉質(zhì)細膩、味道鮮美、營養(yǎng)豐富的特點廣受市場青睞。近年來,我國羅氏沼蝦養(yǎng)殖產(chǎn)業(yè)規(guī)模持續(xù)擴大,2023 年養(yǎng)殖產(chǎn)量已近 20 萬噸。然而,疾病頻發(fā)、種質(zhì)退化等瓶頸問題嚴重制約了產(chǎn)業(yè)的可持續(xù)發(fā)展。在此背景下,開展羅氏沼蝦精準遺傳改良,培育兼具多種優(yōu)良性狀的復(fù)合型新品種,以滿足日益增長的品質(zhì)需求,成為突破產(chǎn)業(yè)發(fā)展瓶頸的關(guān)鍵路徑。但長期以來,由于缺乏高質(zhì)量的基因組資源,羅氏沼蝦的種質(zhì)改良工作整體進展相對遲緩。
針對這一難題,于凌云研究團隊運用 PacBio HiFi 長讀長測序及 Hi-C 等先進技術(shù),成功攻克了羅氏沼蝦基因組高雜合度、高重復(fù)序列占比以及大基因組規(guī)模組裝等技術(shù)難題,最終繪制高質(zhì)量的羅氏沼蝦基因組圖譜。該基因組大小為 2.96 Gb,其中 94.37% 的序列已成功錨定到 59 條染色體上,并鑒定得到 27,111 個蛋白質(zhì)編碼基因,完成 25,470 個基因的功能注釋。此研究是繼成功構(gòu)建 “臻珠 1 號” 羅氏沼蝦 200K 育種芯片和指紋圖譜等成果后取得的又一突破,不僅為羅氏沼蝦功能基因組學(xué)研究和分子育種工作提供了基因資源,更為推動羅氏沼蝦種質(zhì)創(chuàng)新、加速產(chǎn)業(yè)高質(zhì)量發(fā)展奠定了堅實的技術(shù)支撐。
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